Florence Maruéjol séjourne en Egypte entre 1981 et 1986.
Pendant ces cinq ans, elle termine sa thèse de doctorat de 3e cycle en égyptologie soutenue à Paris IV-Sorbonne ; elle travaille au Centre d’Étude et de Documentation pour l’Égypte Ancienne au Caire ; elle participe à la mission de fouilles du CNRS dans la Vallée des Reines et enfin, mène l’étude d’un obélisque d’Hatchepsout dans le temple de Karnak dans le cadres de missions du Centre franco-égyptien d\'étude des temples de Karnak).
De retour en France, Florence Maruéjol choisit de s'orienter vers l'enseignement et l'édition. Depuis 1996, elle enseigne à l’Institut Khéops Égyptologie à Paris. Et elle écrit beaucoup sur l'Égypte pharaonique.